Se localiza entre los paralelos 20° 26" y 20° 31"de latitud norte y los meridianos 89° 09" y 89° 15" de longitud oeste. Colinda con los siguientes municipios: al norte con Tekit, al sur con Teabo, al este con Cantamayec y al oeste con Chumayel.
La población Mayapán "Bandera de los Mayas" es uno de los municipios creados en la primera mitad del presente siglo.
Hasta el 24 de enero de 1923 fue rancho del municipio de Chumayel con el nombre de Mayapán.
El 8 de agosto de 1935 el Decreto número 248 crea el municipio de Mayapán.
