La cabecera del municipio es Cantamayec. Además, dentro de la jurisdicción municipal quedan comprendidas tres localidades consideradas las más importantes y son: Nenelá, Cholul y Chichican. También se encuentran las siguientes localidades: Dolores, Talek, Jesús Man, Tixcacal Pérez, San Martín, Dzidzilché, Actún-May, Múch, Chacxúl, Nicté, Chimay, Chalanté, Yuyumal, Sodzil, Kojobchaká, San José Xikó, Santa Candelaria, Trinidad, San Carlos, Kulkabapop, Revolución, Yokdzonot, Chac-Motul, San Isidro, San Juan, San Pedro, Chác, Dzán y Kambul.
Cantamayec "Los de cuatro Árboles de Tamay", existe desde antes de la conquista.
Después de la conquista, permanecio bajo el régimen de encomiendas.
Su desarrollo comienza el 1821 cuando Yucatan se declara independiente de la corona Española.
En 1825, Cantamayec pasa a formar parte del partido de beneficios bajos, cuya cabecera es Sotuta.
El 18 de enero de 1917, se eleva a la categoria de municipio libre, hasta entonces comisaría de Cantamayec.
En 1930, Cholul, localidad perteneciente al municipio, adquiere la categoría de pueblo.
En 1940, Nenelá, localidad tambien perteneciente al municipio, adquiere la categoría de pueblo. Ambas como cabecera a la población que lleva el mismo nombre del municipio.
Se encuentran, entre otros el templo en honor a San Luis, construido en el siglo XVII ubicado en la cabecera municipal; Templo en honor a San Miguel Arcangel, que data del siglo XVIII. Existe una zona arqueológica denominada Ohican, localizada en los limites del municipio.