La cabecera del municipio es el pueblo de Opichén. Además de la cabecera, sólo existe una localidad: Calcehtók. Otras de menor importancia son: Cok, Kaukiriche, Santa Rita, Mena, San Esteban, Santa Rosa, San Antonio, Siuch, Ojina y Rancho Xikim.
Opichén "pozo de las anonas", perteneció al cacicazgo Maní de Tutul Xiú en la época prehispánica.
Durante la colonia, bajo el régimen de encomienda, estuvo a cargo de Iñigo de Sugasti en 1607; Pedro de Santo Domingo Campos y Diego Hidalgo Bravo en 1639; Juan Esteban de Aguilar, Cristóbal Matías Hidalgo Bravo, Juan Esteban Tello de Aguilar en 1652 y Ana de Vaneda Villegas en 1705. Fue pueblo del partido del Camino Real Bajo, en 1825.
En 1847, fue escenario de algunos combates de la Guerra de Castas.
En 1900, registró un período de prosperidad en la producción de maíz y ganado bovino.
En 1911, el político Delio Moreno Cantón encabezó la oposición al gobierno de Nicolás Cámara Vales.